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实时荧光定量PCR探针技术概述.
资料介绍
一、探针的基本定义与作用
实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)探针是一种在PCR反应体系中用于特异性检测靶标核酸序列的寡核苷酸分子。其核心功能是通过与扩增产物的特异性结合,在PCR过程中实时释放荧光信号,实现对模板DNA/RNA的定量分析。与SYBR Green等非特异性染料相比,探针技术具有更高的序列特异性和检测灵敏度,可有效避免非特异性扩增产物(如引物二聚体)的干扰。
二、探针的化学结构与分类
(一)TaqMan探针
1. 结构特点:5'端标记荧光报告基团(如FAM、VIC、HEX),3'端标记荧光淬灭基团(如TAMRA、BHQ),探针长度通常为20-30 nt,Tm值比引物高5-10℃。
2. 工作原理:PCR延伸阶段,Taq DNA聚合酶的5'→3'外切酶活性将与靶序列结合的探针水解,使报告基团与淬灭基团分离,荧光信号释放。荧光强度与扩增产物量成正比。
3. 优势:特异性高,背景信号低,支持多重检测(多色探针组合)。
4. 局限性:设计难度较高,需避免二级结构;成本高于染料法。
(二)分子信标(Molecular Beacons)
1. 结构特点:茎环结构,环部为靶序列互补区(15-30 nt),茎部为互补的短序列(5-7 nt);5'端标记报告基团,3'端标记淬灭基团(如DABCYL)。
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