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碱基编辑之外的调控型CRISPR技术
资料介绍
一、CRISPR系统的功能拓展:从基因编辑到表达调控
CRISPR-Cas系统原本是原核生物抵御外来核酸入侵的适应性免疫系统,经过人工改造后,最广为人知的应用是基因编辑——通过Cas核酸酶切割靶DNA,引入插入缺失突变实现基因敲除,或者通过同源重组实现精确碱基替换,也就是我们熟悉的碱基编辑、先导编辑等技术。但随着研究深入,科学家发现CRISPR系统的价值远不止切割DNA,通过对Cas蛋白进行失活改造,结合不同的功能结构域,能够开发出不改变基因组DNA序列,仅在转录、转录后、表观遗传层面调控基因表达的调控型CRISPR技术,这类技术已经成为基因功能研究、药物开发和疾病治疗的重要工具,填补了碱基编辑无法实现的可逆调控、多基因协同调控等应用空白。
二、失活Cas蛋白:调控型CRISPR的核心骨架
几乎所有调控型CRISPR技术都以**dCas(dead Cas)**为核心骨架,常规用于基因编辑的Cas9、Cas12a蛋白都带有两个核酸酶结构域,分别切割DNA的两条链,将这两个核酸酶结构域的催化位点进行点突变后,Cas蛋白就失去了切割DNA的活性,但仍然能够在gRNA的引导下,特异性结合到靶基因组位点,相当于一个可编程的DNA结合锚定蛋白,通过在dCas的N端或C端融合不同的效应结构域,就能实现不同的调控功能,这是调控型CRISPR技术开发的核心逻辑。
除了dCas,部分调控型系统也会用到切口酶Cas(nCas),nCas仅突变一个核酸酶结构域,只能切割DNA单链,也可用于部分表观调控场景,但最常用的骨架仍然是完全失活的dCas。目前应用最广的dCas是来自酿脓链球菌的dCas9,其次是来自Lachnospiraceae菌的dCas12a,后者因为PAM序列偏好不同,能覆盖更多靶位点,而且gRNA加工更简单,适合多靶点调控。
三、主要的调控型CRISPR技术分类与原理
根据调控层面的不同,调控型CRISPR技术可以分为转录调控技术、表观遗传调控技术、转录后调控技术三大类,每一类都有代表性的技术体系。
(一)转录调控技术:激活或抑制基因表达
转录调控是调控型CRISPR最成熟的方向,核心是通过dCas招募转录激活或抑制结构域,直接改变靶基因的转录水平,不改变基因组序列。
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| 1784507848碱基编辑之外的调控型CRISPR技术.docx | 18K |
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