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平滑粒子网格Ewald互易和计算机的FPGA实现
资料介绍
目前，分子动力学模拟主要由微处理器集群或定制ASIC系统加速。然而，微处理器的功耗和定制ASIC的非经常性工程成本可能使这些系统不具有成本效益。随着现场可编程门阵列（FPGA）性能和密度的提高，FPGA系统现在能够以经济高效的方式加速分子动力学模拟。
本文描述了FPGA计算引擎的设计，实现和验证工作，称为互易和计算引擎（RSCE），使用Smooth Particle Mesh Ewald（SPME）计算静态能量和力的倒数空间贡献。算法。此外，本文还研究了RSCE的固定有针对性精度要求，加速能力和并行化策略。该RSCE旨在与多FPGA系统中的其他计算引擎一起使用，以加速分子动力学模拟。
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| lee.thesis05.doc | 9M |
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